Op dit moment is er geen behandeling die de ziekte van Canavan kan stoppen. De behandeling helpt om de klachten zo goed mogelijk te bestrijden. Zo kan het kind zo prettig mogelijk leven.

Er loopt onderzoek naar een nieuwe behandeling met glyceryltriacetaat (GTA). Met GTA krijgt het lichaam acetyl-eenheden. Patiënten met Canavan hebben een tekort aan deze stof. Acetyl-eenheden zijn nodig voor het aanmaken van myeline. Patiënten verdragen het middel goed. Maar de behandelde kinderen gaan vooralsnog niet duidelijk vooruit in hun motorische ontwikkeling. Misschien komt dat doordat er bij het begin van de behandeling al hersenschade was. Er is meer onderzoek nodig. Bijvoorbeeld bij patiënten die nog geen hersenschade hebben. Ook moet duidelijk worden wat de behandeling op de lange termijn doet.