Het syndroom van Bartter is deels te behandelen. Met de behandeling worden de klachten zoveel mogelijk verminderd. De behandeling is vooral gericht op het aanvullen van de zouten en mineralen die verloren gaan. Dat zijn vooral kalium, en soms ook natriumchloride en calcium. Met de juiste behandeling zijn de vooruitzichten voor de patiënt meestal goed.